MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 7715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015564	TTC	2	6	3663681	3663686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_015564	CAA	2	6	3663688	3663693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_015564	GGA	2	6	3663695	3663700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_015564	GC	3	6	3664768	3664773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_015564	GGCC	2	8	3667967	3667974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_015564	TTG	2	6	3668015	3668020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_015564	GAG	2	6	3672780	3672785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_015564	TAC	2	6	3672789	3672794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_015564	TGA	2	6	3672823	3672828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_015564	CCA	2	6	3672847	3672852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_015564	GAA	2	6	3672861	3672866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_015564	GGA	2	6	3675092	3675097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_015564	GC	3	6	3675532	3675537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_015564	CGT	2	6	3675638	3675643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_015564	CAA	2	6	3676971	3676976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_015564	GAA	2	6	3677012	3677017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_015564	ACGC	2	8	3680019	3680026	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_015564	GAA	2	6	3680114	3680119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_015564	GC	3	6	3680184	3680189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_015564	CGC	2	6	3680192	3680197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_015564	GGGT	2	8	3683863	3683870	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_015564	ATG	3	9	3683898	3683906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_015564	GGC	2	6	3683928	3683933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_015564	ATCC	2	8	3683934	3683941	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_015564	GT	3	6	3685212	3685217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_015564	GT	3	6	3685269	3685274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_015564	TCC	2	6	3686234	3686239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_015564	TCG	2	6	3686241	3686246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_015564	GTA	2	6	3686270	3686275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_015564	GA	3	6	3686276	3686281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_015564	GCA	2	6	3686296	3686301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_015564	CCATC	2	10	3686909	3686918	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6033	NC_015564	CAA	2	6	3686958	3686963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_015564	GGT	2	6	3686976	3686981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_015564	CA	3	6	3687951	3687956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_015564	CA	3	6	3687971	3687976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_015564	GCCG	2	8	3688027	3688034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_015564	GCC	2	6	3688040	3688045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_015564	GCG	2	6	3688894	3688899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_015564	TGGA	2	8	3698530	3698537	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_015564	AGG	2	6	3698579	3698584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_015564	GACGT	2	10	3698586	3698595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6043	NC_015564	CA	3	6	3698655	3698660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_015564	GAC	2	6	3698690	3698695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_015564	GA	3	6	3698867	3698872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_015564	GC	3	6	3698974	3698979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_015564	C	6	6	3699045	3699050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6048	NC_015564	ATG	2	6	3699090	3699095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_015564	GC	3	6	3699142	3699147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_015564	CGG	2	6	3699943	3699948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_015564	TCCG	2	8	3702169	3702176	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_015564	CGC	2	6	3702183	3702188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_015564	TGC	2	6	3703012	3703017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_015564	GCG	2	6	3703154	3703159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_015564	GGC	2	6	3703968	3703973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_015564	GC	3	6	3703978	3703983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_015564	CCT	2	6	3704723	3704728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_015564	TCG	2	6	3704749	3704754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_015564	CGT	2	6	3704755	3704760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_015564	GCGA	2	8	3706419	3706426	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6061	NC_015564	TTC	2	6	3706448	3706453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_015564	CCA	2	6	3706935	3706940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_015564	CCA	2	6	3706958	3706963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_015564	CA	3	6	3706962	3706967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_015564	CGCAC	2	10	3708314	3708323	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6066	NC_015564	GAG	2	6	3708325	3708330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_015564	CTCGT	2	10	3708943	3708952	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6068	NC_015564	GCT	2	6	3708969	3708974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_015564	AGA	2	6	3713039	3713044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015564	GCT	2	6	3713053	3713058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_015564	GCAG	2	8	3713084	3713091	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_015564	TCC	2	6	3714887	3714892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_015564	GC	3	6	3714898	3714903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6074	NC_015564	TGC	2	6	3715200	3715205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_015564	TCAT	2	8	3715235	3715242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6076	NC_015564	TCC	2	6	3716719	3716724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_015564	CG	3	6	3716768	3716773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_015564	ATC	2	6	3716785	3716790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_015564	CCG	2	6	3717985	3717990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_015564	CG	3	6	3717995	3718000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6081	NC_015564	TGCC	2	8	3718050	3718057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_015564	GAA	2	6	3718160	3718165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_015564	CTC	2	6	3718187	3718192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_015564	AGCC	2	8	3719265	3719272	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_015564	CCA	2	6	3719300	3719305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_015564	GGA	2	6	3719344	3719349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6088	NC_015564	CTG	2	6	3722698	3722703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_015564	GTT	2	6	3722735	3722740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_015564	CATT	2	8	3722758	3722765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6091	NC_015564	TCTTGA	2	12	3722777	3722788	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6092	NC_015564	GATC	2	8	3722887	3722894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6093	NC_015564	GAC	2	6	3722916	3722921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_015564	CGA	2	6	3722939	3722944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_015564	CCG	2	6	3722971	3722976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_015564	CTG	2	6	3723015	3723020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_015564	AGA	2	6	3723021	3723026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_015564	GC	3	6	3724043	3724048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_015564	AGG	3	9	3724052	3724060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_015564	GCC	2	6	3725912	3725917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_015564	GGAA	2	8	3725932	3725939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_015564	CTT	2	6	3726960	3726965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_015564	TC	3	6	3726993	3726998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6105	NC_015564	TGA	2	6	3727101	3727106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_015564	GCG	2	6	3727118	3727123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_015564	CG	3	6	3727139	3727144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6108	NC_015564	TCC	2	6	3727148	3727153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6109	NC_015564	TCC	2	6	3727167	3727172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_015564	CCAGC	2	10	3727251	3727260	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6111	NC_015564	GA	3	6	3727278	3727283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_015564	CAAGA	2	10	3729482	3729491	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6113	NC_015564	TAG	2	6	3729538	3729543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_015564	TTA	3	9	3729554	3729562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6116	NC_015564	GC	3	6	3731245	3731250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6117	NC_015564	TGG	2	6	3733885	3733890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6121	NC_015564	GGCT	2	8	3734280	3734287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6122	NC_015564	CCG	2	6	3734298	3734303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6123	NC_015564	TGC	2	6	3734314	3734319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_015564	GTC	2	6	3734452	3734457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_015564	GTAA	2	8	3734493	3734500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_015564	GCA	2	6	3734504	3734509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_015564	TCC	2	6	3735475	3735480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_015564	ACGA	2	8	3735487	3735494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_015564	GA	3	6	3735550	3735555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_015564	TCA	2	6	3735567	3735572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_015564	AGG	2	6	3736255	3736260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6139	NC_015564	GC	3	6	3741549	3741554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6140	NC_015564	GC	3	6	3741590	3741595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6141	NC_015564	GGC	2	6	3742131	3742136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6255	NC_015564	GGCCA	2	10	3802641	3802650	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6262	NC_015564	CGG	2	6	3809333	3809338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6265	NC_015564	CA	3	6	3809692	3809697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6266	NC_015564	CAGC	2	8	3810349	3810356	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6383	NC_015564	GCT	2	6	3878775	3878780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6390	NC_015564	CGAGC	2	10	3881541	3881550	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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